تا اینکه سال 42 حادثه مدرسه فیضیه به وجود آمد. در سال نو 1342، در سالگرد امام صادق (ع) در مدرسه فیضیه، طلبه ها مجلسی گرفته بودند که ساواکی ها حمله کردند و تعداد زیادی از طلاب را به خاک و خون کشیدند، به دنبال آن صحنه سازی کردند که این ها می خواستند برخلاف نظام شاهنشاهی حرف بزنند که یک سری کشاورز و روستایی با آن ها مقابله کردند. نمی گفتند ساواکیها ریختند اینها را زدند. بعد از آن مراجع و حضرت امام اعلامیه هایی صادر کردند که دستگاه ستم شاهی یک چنین کار فجیعی انجام داده و به مرکز علوم اسلامی حمله کرده و طلاب را ـ شاگردان امام صادق (ع) ـ را به خاک و خون کشیدند. داغ ترین اعلامیه ها، اعلامیه های حضرت امام
کتابامام خمینی و هیات های دینی مبارزصفحه 122 بود که دستگاه از آن روز دیگر شدیدا مبارزه علیه امام را شروع کرد. به مراجع دیگر دستگاه خیلی کاری نداشت و بیشتر مستقیم روی امام برنامه ریزی می کرد، که ایشان را ساکت کند. یک چند ماهی از این واقعه گذشت. خوب این خبرش در همه جا پیچید.
کتابامام خمینی و هیات های دینی مبارزصفحه 123