حاج سید احمد خمینی ـ رض ـ پس از تحقیق و مشورت با حضرت امام و دیگر اعضای خانواده در تاریخ 11 / 7 / 1348 با دختر فاضله آیت الله سلطانی طباطبایی که از خاندان های شریف و محترم روحانیت در قم می باشند که اعقابشان نسل در نسل از مجتهدینِ بنامِ حوزه ها بوده اند، ازدواج نمود و ثمرۀ این وصلت مبارک سه فرزند پسر به نامهای: حسن، یاسر (رضا) و علی است که همگی در سلک روحانیت قرار دارند.
