آیت الله العظمی حاج میرزا علی آقا فلسفی همواره جزو حامیان جدّی نهضت بزرگ امام راحل (ره) بودند و در تمامی راهپیمائی هائی که در سال۱۳۵۷ در مشهد برگزار و برخی از آن ها برپایه اعلامیه امضاء شده از سوی ایشان و برخی دیگر از بزرگان حوزهُ علمیهُ مشهد شکل می گرفت در صفّ اوّل حضور یافته و تا پایان ادامه می دادند.